Uruchamianie systemu
System po włączeniu komputera, jeżeli został zainstalowany menadżer startu Lilo (linux Loader) albo GRUB samodzielnie wystartuje. W przypadku wyboru innego systemu operacyjnego jako domyślnego należy wybrać Linuksa z dostępnego menu wyboru. Jeżeli wystąpiło uszkodzenie programu ładującego trzeba skorzystać z dyskietki startowej albo płyty ratunkowej.
Restartowanie systemu
System restartujemy poleceniem shutdown -r now albo reboot. Nastąpi zamknięcie systemu a następnie ponowne jego uruchomienie systemu. Inny sposób (o ile go nie zablokowano) to wciśnięcie kombinacji klawiszy ALT + CTRL + DEL.
Zamykanie systemu
System zamykamy poleceniem halt albo shutdown -h now. Należy unikać zamykania systemu przez wyłączenie komputera z zasilania (np. wciśnięcie przyciska Power), gdyż może to spowodować uszkodzenia w systemie plików a także błędy w działaniu niektórych programów.