Debiana, tak jak każdego Linuksa, najprościej można odinstalować w dwóch krokach:

• usunięcie lilo z MBRu,
• wykasowaniu istniejących partycji linuskowych.

Pierwszy krok możemy łatwo wykonać wydając polecenie lilo remove lub korzystając z dosowej wersji fdiska i wykonując komendę fdisk /mbr . W każdym przypadku spowoduje to wyczyszczenie MBRu. Drugi krok najłatwiej jest wykonać używając płyty instalacyjnej (albo jeszcze lepiej jakiegoś bezinstalacyjnego Linuksa jak np. Knoppiksa) i przy pomocy programu do tworzenia partycji (cfdisk lub fdisk) usuwać je a następnie zapisywać stan na dysk. To samo można wykonać korzystając z jakiegoś windowsowego programu do zarządzania partycjami (np. Partition Magic).